В рамках федерального проекта «Развитие инфраструктуры для научных исследований и подготовки кадров» национального проекта "Наука и университеты" в Центр коллективного пользования технологичным оборудованием по направлениям был приобретен амплификатор марки QuantStudio 5 Real-Time. С его помощью на базе селекционно-питомниководческого центра (СПЦ) ФГБНУ СКФНЦСВВ проводятся работы по отработке и разработке методов диагностики посадочного материала на наличие вирусной и фитоплазменной инфекции. Основной целью функционирования СПЦ является создание отечественного посадочного материала высшей категории качества.
      Важнейшим аспектом при производстве исходных и базисных растений, оздоровленных от основных вирусных и фитоплазменных патогенов, является наличие эффективных методов диагностики этих вредных организмов.
       Учёными ФГБНУ СКФНЦСВВ отработаны молекулярно-биологические методы, основанные на ПЦР-технологии, для идентификации вирусов и фитоплазм семечковых, косточковых культур и винограда, обладающие высокой чувствительностью и точностью, что позволяет выявлять заболевания даже в латентной форме. В инструментарии специалистов появились методы для выявления следующих вирусов и фитоплазм: вирус хлоротической пятнистости яблони, вирус крапчатости древесины, вирус мозаики яблони, вирус ямчатости яблони, фитоплазма пролиферации яблони, фитоплазма истощения груши, вирус некротической кольцевой пятнистости, вирус карликовости косточковых, вирус линейного рисунка сливы, вирус шарки сливы и латентный вирус абрикоса

Большинство представленных болезнетворных агентов находится в списке вирусов и фитоплазм, заражённость которыми не допускается по ГОСТ 59653-2021 «Материал посадочный плодовых и ягодных культур. Технические условия», а часть из них также находится в списках карантинных объектов EPPO.
      Для проведения диагностики патогенных агентов необходимо наличие широкой базы различных методов для подтверждения положительного результата тестирования ориентируясь не только на проведение повторных анализов, но также на проверку результата другим способом. В качестве дополнительной методики исследователями Центра отработан серологический метод на основе DAS-ELISA для 3-х вирусов косточковых культур: некротической кольцевой пятнистости косточковых, шарки и карликовсти сливы. В работе использовались наборы компании Loewe Biochemica. Также для подтверждения положительного результата планируется использовать классический метод оценки на основе индикаторных растений.
      Для удешевления и снижения времени затрат на диагностику вирусов и фитоплазм производится разработка мультиплексных наборов. Предложен мультиплексный набор для одновременной оценки в одной ПЦР реакции вирусов шарки и некротической кольцевой пятнистости косточковых. Данный метод проходит проверку по ряду важных методических показателей таких как аналитическая чувствительность и специфичность, селективность, повторяемость и воспроизводимость. По части показателей эффективность мультиплексного метода была подтверждена, что показывает его перспективность для дальнейшей разработки.
       Важным этапом идентификации вирусов методов ПЦР в реальном времени является получение высококачественного препарата РНК. Отсутствие универсального способа, позволявшего выделять РНК из разных культур способствовал разработке оригинальной методики сотрудниками ФГБНУ СКФНЦСВВ. Предложенный метод, оригинальность которого подтверждена экспертами Роспатента, позволяет извлекать высокомолекулярную РНК из различных органов семечковых и косточковых культур. Сейчас этот метод является основным в СПЦ при получении препарата НК из различных растительных объектов садовых культур.
       В дальнейшем планируется отработка методов диагностики посадочного материала земляники на вредоносные вирусы: вирус морщинистости земляники, вирус крапчатости земляники, слабого пожелтения краев листьев земляники, окаймления жилок земляники, латентной кольцевой пятнистости земляники, мозаики резухи, черной кольцевой пятнистости томата, кольцевой пятнистости малины, а также фитоплазмы позеленения лепестков земляники. На данный момент проведён поиск подходящих праймерных пар в различных научный источниках и их закупка, подбираются режимы амплификации и осуществляется поиск положительных контролей.

journal тематический сетевой научный
электронный журнал скфнцсвв
Яндекс.Метрика